Genomic Feature
ka709
- ID
- ZDB-ALT-210831-2
- Name
- ka709
- Synonyms
- None
- Affected Genomic Region
- Construct
- None
- Type
- Allele with one deletion (1)
- Protocol
- embryos treated with
- Lab of Origin
- Strähle Lab (Closed)
- Current Source
- European Zebrafish Resource Center (EZRC) ( order this )
- Other Pages
-
Notes
No data available
Variants
- Variant Type
- Small Deletion
- Variant Location
- Chr 25: 15031604 - 15034614 (GRCz11) (1) Details
- Nucleotide change
- AAGAGGGTAAGAAGGGCAAACCTGTCAACAACACTCATGTCTCGCATAAACAACCTTCTAGTCTTGTCTGTATGCTGCGCTTGCGTAAGACCTTACAGCGCTCAGCAATATCAAATTACTAATCCTCTCAAACTGGACGTACTTGCATAGGAAGGTTGTTGGCCATGGTGAAGCTTGGCATTGGTGGCAGGGCGCTGTATGTGTTCGTAAGAGCTGTGTCTGATCTGCCCAACATGGAGCCTGACGTAAAGGATACTGTTTAAAGGATAAAAATGCACACTTAGTATCTTGCTTATTAGAAGTAGTGGGTGCATTCGAGTAGATTGGGACACTTTTGCCATTGAGATGACTGGAAAACAATGTCCCAGTCAACCCAAATTTGCACTTGATTAAATAATGTTTGCTTTATTAAAATAGTATTTGCTTATCAATCATTTTCAAGCGTTTACCTGGCGTTGTGGGCTGAGGGATTGGTTGATAGACACTTGTGCTGAAGCTGCTGCTGATGGGTATGTGACTTGAGGAATTACTGGCTTGTCTTCTTTGATTTCTTAACTTTTCCTCCCTCCTCCATTTCGCTCTTCTGTTTGAGAACCAGACCTGGATGCACATATTTTTGTTTAGTTGGTGTGAATCTATATATATAGACAATTTTGCTGCAGATTTAATTTTCAAATACATATAGATTTCCATAAGGATTTCCATATTATGCAGAATAAGAGCACCTCTCTACATATTTTATACAAAAATATTGAATTTTGACAGATGAAATAACATTTTAAAATAACAAGAATAATTACTTAATTGTAGAAAGGTTTAGACTTATAAAATTATTTTTATTTTACTGAAAATATGGTACTTTTCTATATCATTATTTTCAATTTCAAATGTTTTATAGATTTTTTATGCAATTTAATTTCTCAAATGCATAAATGTGTTACAGAAACATGAAATATAACATATTTATATTATGAAATATGAACAATTAAATAAACATTCTTTAAACCATTTTAATGTACATATTTATGTTTAATTGGTTATCAATAATTAAATAGAGCAGGTAATAGAAATACAGACCCTGTAGAGTAGTATAGAGCTTAAAGGTCCCTAAAGCGCTTTGAAATGTGCAGTTTTATTCGATGTTTGACCTAATCTCAACTGAAACATGAAGACAGGGTGGAGCAAATAGTAACTCCTCCCCTTTTTGTAACAGCTCTGTCTGTGAGAGTGGTCAAGCTCAAGCACATATAGTAATAGCATCTTTAAGGGGGTGGGACATCTTAGATACTAGAGAGCATTTAATTGGTCAGAGGATTTGATGGTAAACTGATGTACATTTGACATCAGAATTATTAGCCCCACTTTGAATTTTTTTTCTTTTTTAAATATTTCTCAAATGATGTTTAACAGAGCAAGGAAATTTTCACAGTATGTCTGATATTTTTTTTTCTTCTGGAAAAAGTCTTATTTGTTTTATTTTGGCTAGAATAAAAGCAGTTTTACATTTTTAAAAAAACATTTTAAGGTCAAAATTATTAGCCCCTTTAAGCTAATTTTTTTTCGATAGTCTACAGAACAATCGTTATCCAATAACTTGCCTAATTACCCTAACCTGCCTAGTTAACCTAATTAACCTAGTTAAGCCTTTAAATGTCACTTTAAGCTGTATAGAAGTGTCTTAAAAATATCTAGTAAAATATTATTTACTGTCATCATGGCAAAGATAAAATAAGTCAGTTATTAGAGATGAGTTATTGAAACTATTATGTTTAGAAATGTGTTGAAAAAAATCTTCTCTCTGTTAAACAGGAATTGAGGAAAAATTAAATGGGTGTGGGAGGGGGGGTCTCTGCCAATTAAACTTTGGCTAATAATTCAGGGGGGCTAGTAATTCAAATCATAATTTGGCAAATATTTAAAAAAGAAAAAAATCAAAGGGGAGCTAATAATTCTTACTTCAACTGTACATGGGGGTTTATTTCCTGTTGAAACAGGAACTTTGAATGCTAATTTGTTTTTTTTTTTGGTTTTATTTTATAAAGTAAAATGTATTCATTTAGATCACAGATACTTGATAGTGATAGCGATACTAGACAGATACAAATCGATTTAGTGTGTGGGACATTCTCATTCTACAGAGCGTCTGACTGGATGGAAATGATGAGTCATCAGTATTTTTGTTGTTTCTTCTGAAGGAGAGATTTACTTGATTTATTAAAAACTAAAATGTTGTTTTCATAACAATAGTTTACATGCCAAAAATCTTGTAAAAACAAGCATTATTTGACGATGCCTATTCATCCTGTTTTTGTACATTAGTTTGTCCTGTTTTCACTCACCTGTATTCTTGCTTCTGGTAAATCTATTTTTGCAGCAAGTCTTTCTCGTGCAAAAACGTCAGGGTAGTGCGTTCTTTCAAACTCTGGTGGAAACAAACAAAAATAGGAAACATTTTGAAAATGCTACAATATTGGGCAAAAAAGTTAAATATTTGATATTTTTTAGGGCCGGGTAACTTAAATGTCCGCATTTGATTAGTTTATTACAAATAATTAATATGGCTTAAACACACTTGCTATTGATATTTTTTAAAAATGAACCATAAATATTTAGTATATTTTAGTTTAGTATAAATAGTTTATTATATTAAAATCTTTTATCTTAAGCACAAATAGTTACGTATAAACATAAATCATCACTTTATTGCAAATGCATACAAGTTTGAATCTGGAATACAGAACATAAGAATATTAATCAATTCTTTTAAGGACATATATTAAACTAGCCACATTTCAACAAGTTATATTGTTCCTAATTATTTTGTTAGTTTGTAACAGATGCTGTAATATTCGCTATAATCTCCATGTTTACCTTTTTCAAGTGCTTCTATTTGTTCTTGTGTGAAAGAAGTGCGATTCCTTTGCAGTTTTCGTTTAAGCTGAAGCCTCATTTGGGTCTCATCTGAGTCCTCGCCATTGGAGCTTATTGAGTTTGTGTTCTCACCGCCTCCG/-
- Variant Notes
- None
Effect on DNA/cDNA, transcript, protein (from publications)
- DNA/cDNA Change
- 3011 bp deleted (1)
- Transcript Consequence
- None
- Protein Consequence
- None
- Flanking Sequence
-
TAAATATTATTTATATTACTAAATATAAATATTTTTAAACCACTTTAATATTAATAATTAAGCTTGTCATATTATGTAATTGTTAAAGAAAATGCATAAATATTTTAGGATTTTTTAAATTCAAAATTTAATAAATGTAAATGCAGAATGTTTAGGTTTTACATTTTACGTTTACATTTCTTAGAGCATGTTTCTTGATAGTGCACATTGTAGCAAAAAAAAATAATTATTATTTTGTAAATATATTATTAATTTAAATTTTAAAAAGTTCAATATTCAGATTTTAATTTTTTTTTATTATTTTTTTATTTTTTTATTTTATTTTATGCAAATTCAAATGCAAATTCTCTTACCCGTTGAGGTTGTGCCCGAGGCGGCCATTGATTGGCTGTTCATATGCGCCTGCATGTGCGGGGGTGTGTATGTGTCATAGCTCCGCCCGTTTACTGAAGGACTAGTGGGCAACATGCAGGAGTAGGATGAGGTCTGGCTGGGCTGTG
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- None
Fish
Supplemental Information
- Genotyping protocol
- None