Genomic Feature
nc100
- ID
- ZDB-ALT-231024-2
- Name
- nc100
- Synonyms
- None
- Affected Genomic Region
- Construct
- None
- Type
- Allele with one delins (1)
- Protocol
- embryos treated with
- Lab of Origin
- Bautch Lab
- Current Source
- Other Pages
-
Notes
No data available
Variants
- Variant Type
- Delins
- Variant Location
- Chr 25: 2282123 - 2286666 (GRCz11) (1) Details
- Nucleotide change
- GGGTGTTTTGTTGATGTACTGTTCTAGTGGGGGATGGGCGCTCAAAGAAGGCGGATCTCCGGTGCTCCAATCCCCTGCCGTCCCCT CGTCCTTTAAAGAGCTCTTTGTGTCAATCACGCGTTTTTTTCGCCCTCTTTCCCCCCTTCATCGCCATATTGGGCACCGAAAAGCCT CGCCTTGTTATTTCTCTTCCCCCTTTTTTTTTACTACGCGTCTACGCCTCGCAGTTGACAGGAGTGGCCATCGCGAACGCTGCTTTTG TTTTGATGATCGTCTTGTCGATGTTTTTTTCGCTCATGCGGCCCGTCGTTGTGGATCGCGTTGGAGTAGCTCTGTAACAGCTGTGTT TTCGTCTCAAAAATGTCCAATGTTCGCTTGTCTAATGGCAGCCCGACGCTGGAGCGGATGGAGGCGCGACTGTCTGACCAACCGA AGCCGTCGGCATGTCGAAACCTGTTCGGGCCGGTGGATCATGAAGAGCTGAAGAAGGACTTCCAGCGGCAGCTCCGGACGATGG AGGACGCGTCGGCTGAAGCCTGGAACTTCGACTTTTCCACGCACACGCCGCGCGCCGACGGTAGATATCAGTGGGAAGCGCTGGA TATTCGCTCGGTGCCCGGTTTCTACAGCCGATCGGAGCGGGGGAAGGGCTCCGATATTCACATCTCCTCCTCTGGGAATAATAACG ACAATAACGTGGATGTTAACGGGAATCACGACTGTAGGGTAACGGAGCAAAGCGCGGAGACGCCCGAAACGCTCCGAGAGCCGA GGAAAAGAAGCTCCTGTCTCGGTATGTGCTTTGAATTTTGACCGTTAAAAACTTTAAAATGTTGACCGTTGACATTTTAAATCAAA CCGAAAACGGTTTATTTATAGCCTACGTGTGTATGGGTGTATATGATGTGGCTTATGCTCTATATCTCGGAATGTGTTTAACGTTAT TAGTTTTAAGCTTTTCAAACCTACATAACAACTGCGTTGTGCTTGTGACGAACTACGTTTAATTAATACGTTAAATCTACATGTACT ACTTTCAAAACTAAAATGGCTGTATTTTAAATTAGTTGTTTTAACTTTTGTTAACTCAAATATGGACAAGTCCAGCTGTTGCGTTAA GTTTTTCCAGGTAAATTTAAATTACACTTAAAACACAAGCGTTGGGTTTGTGTGTAGTTGACCCACTTGAGTTGTAACTATTTTTAG TGTACAAAAACTAAATTATACATTTCATACGCACTTTTAAGTAGTTGTATTTTGTAGTAAAATGGAGTTTAATCCTTAAAACGATA ATTTATTTAGCTATTTACATGTGTTTTTGTTCTTTTCAACCAGTGTTTGACAATTAAATACTTTTTTTTATTATGTCAGACTCATCGT GTCAAAGCAAACGCTCGCACATCTGTGTGGATGAAGTGACCCGAACGCCCAGAAAACCCAAAAAACCCAGAAAACCATTGAGTC CGACACCCACATAAACACAATGAGGTAAGCACAACATTTTATACTTGAATATTGTGTTATACAGAAAGTTTACAGTTGTTTATTGA TTCTATATAACAGGGGCACATGTCTAAAAAAGAAAGGATGTGTTCTAAAATCTTTAAAAACACTACTCGATTTAACATTAATGTAC CCTAACGTCAACTTAACGGTTATATAAATATAAAACATCCGGCTTTTTCCGTATAATAACCTAAAGAGAGTGCGTGTGTGTGAATG TGAAAGGGTTAAAATGGTGCGTTTACTACGAGAGCTCGAGTTTCCTTCAGAGTGAAAAACATTTTACACGTCAGCAGTGTTCACTA TCGAGGGACTTCAGAGTGTCATTCACACCTCCACTCGACTACTATCATCTGAAACCGCGCATATATAATCACAAGTTCGCGCTAGT ATCCTTTAAGTGCAGGTTTGAGGTGTAAAACCGAACACCTGGAGTCTGATTGCAGGTCGTGTCCGTAAATCTGATGTAACTTCAGG TTGTTGTGTGCTCAGTTTAGTCATGTGAGGAAATGTGCAGCCAAATCGATATGTCAGAGAGCAAATAACAGTCGGTCACGGCGCA TTTATAAAGTCATAACATCAGTAATGAGGAGTGTTTTGCTTTGGTGGGACTCCAAATGTTTCGTGAGCTCATTTTTCCAGTGTTTTT GTTTCCTGCTGTAGTTTCATTCAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGGTGGGTTGTGCTGCTAGTTTGGTTTGTGGTGAAGTCGAGTCAG AAGTGAAGTTATCTGCAAGAGTCAACAGTTTTATTGCTGTTTGTTTATACGTATGTGTAAAATGAAGTTAAGATGAAGTAATAATC ATTCTGAAGTAAATTAATAATGGACTGATCAAATATTTGAAGCTATAAATAGGCCTGAATGTAAAGATTATTTCAGTGTGTTGCGC AAGAGTTCAGTTTTTGTATTTTAGATTGTCATATTTAATTTATTAAGTTAAATGTGTCCTTAAAGTGTTGCATAACTTTTAATGGCTT GTTTTTAGCTCATTTTAATTCAATAACATTTGAAGAAATGTGTGGAAATGCTGATATACAGTAAAAATGTGACATGTTTTTAATAT TGCGTTAATTTGTTAAGCATATATTTATATGTTTAACTTAACATTTGATTGGTGCAAGTTGAGATGACTGAGGTTCATTTAATTTAA CTAAAAATGTTCAGGCAGCAAGATTTTTGTTTATTTAGTTTTGTAGATTTCATTTTAATCTGTTTTACATTGGATTAAATTTGAAATT GTGAAGTTATAAGTTGAATAATGGAGTTTGTGTAATAAAAAAAATCTGTTGTGAGTTATTTTAGTTATATAATTATTATATATAAC AAAGATAAACGTTTATAGGCTACTTTTAAATAAAACAAGAAAAAATAAAATGAAATATTTCTAAAAGTTTAGTTTGGGCTTGCTG CCAAGAAATAACGTCACTTAAAATAAAAATAAAAAATACAGACAGAGTTGCATCTTTAAAAAAGTGAACCCAAAAATAAGCAAA ACGCGCAACAAAAACTCAAACTACAATGAAAACTTGTGTCTGTAGATGTCAGAGTAAAGCTGAAATACACTGAAATCTGACAGTG TGTTTATATTGCTTTAGTTAAATTTATTCATATACACTTAACTTGACATTTGATCGGTGTAAGTTGAGATGACTAAAGATAATTTAA TTTAACATAAAACATTGAAGCAGCAAGATTTTCCTATTTTGTTTTGGAGAGTTTACTCAGTTTTTACATCGGATTAAATACAAAATT GTGAAGTTATAAGTTGAATATTGGCGTTTGTTAAATTAGAAAAAAATCCATTATTCCAGATCTTGTATTTAAAAATGTAATGTTCA ATCTGTTGTGAATTATTGTAGTTAATCAAGGTAAATGTTTATATGCTACATAAAACAAACAACAAGAAATACAATTATATATTTGT GAAAGTTTCATTTGGGCTAGTTGCTCTCAAAAAATGACTTTTGCTACTTTTGTTTAAACGACTTCTTTTGAGTTGATACAACACAAT TCTTAAGGGTTTTTTGAGGGACAACTTAATTGTTTTATGTTCAATCCAGTTAAATTTAGAAAAAAACAATTAAGGTAACGTTTTGG GACAATATGACGGAAATTTGTGGAATTCAGTATTGTTTACAGTGTGCCAAGAAATAACTTTTCTTTTGGTCTGTATTTTCACTTAAA GTTAAGTGGCTCCTTTAAAAAAAAAAAAATAACCAAAAATGCTGAAGCATGCAACAAAAATTCTAACTATAGTTAAAAAAAGAT TAATGTACTCTAAAATATCTGTCAATTTTACATTTAAAACCAAATGTCTAAGTAATCTTTTTCTATGTGGTGTTTATATCTTGCATTT AACACTTACTAATTCTCTGTAATGTTTCCCGACAGGCCTGAAGATGTCGTCATTGTCGTCGCTTCGATGACCTCAGTGCCTGGTGG CTGATTTTTCTATATATTTTGTTTGGGCGTCTGAAAAACAGAGGAGCGAGGAGGGGGAATAAAGAGACATATCAACTCTACGAGT GTGTTCAAGCACTGAATCAGAAACACTAAAAACTTCTGGCACTCAACAATAAAGCAACTGCCTCTGAGAGCAGTTAATGTAGCAG TGTGCAATTAGGTTGAATTTCCTTTTTTGCTCATATATTTTGTTTTCTTACTACCTGTGTATATACATTGTTTCCTTTTTCCCTTATGT AGCACATAATTAGTATTATGTTGTAAAAATGAAAGATTAAAAAAAAAAAAGTATATTGTTTTATTTTTGGAGGTGTGATTTTGGTT TGACTTGAAGAGCCACCGTTGTTGCCGTGTGTAGATTATTTCCAAAATGCTGTTCATTATTGTTTGTGTTGCATTTAATTTGCATAT TGGTTGTGTAGTAAATTTATATTTGGTACACATAAAAAAGCACCGTTTTTGTTTTGGATGTGAACATCTCAGTCTGTTTTAATTGTT AAAATCTCAAACTCTGAGGTCAAACCTTGTAGCATCGACCAGTATTACTATCAGGCACTT/ATCCC
- Variant Notes
- None
Effect on DNA/cDNA, transcript, protein (from publications)
- DNA/cDNA Change
- 5 bp inserted / 4544 bp deleted (1)
- Transcript Consequence
- None
- Protein Consequence
- None
- Flanking Sequence
-
CGTCACGAATGAACCGAATCTTTTAAACGAATCAACGGAACAATAGATGCCCGAATCACTCGATTGTAGTAAAACTATTTGGGAGTAATTTAAACAGTTTTGGAGTACATATAATAAAACAGCAATTATATACAAAGTCAATAATTCGACATTATTACTAAGTGCACGGTCGCTTCATAGGGAACTGCTGAATTAAGATACATTTGGCTTTATATTCGCACATTTGGACTTTTTTAACAATATAATTTCAGAATAATATTATTTGCCAGTTCTAAATGGGGAAATCATATTAGCAGTTACTGACTCTCAAAGTACAACTTTGTTCACAGTCAATTAAATAGTGATGATGTTGTTTTCAAGTTATACTAAATGCGATTTCAGAGCCAATGTAGCGTGGTAAACAAGAACCAACTTTACCTCAATAACTGCTGCGAGTGAAAGGAATCGTTTACCGAACCGAGTCACTAAACAAAGTGACTCATTTGGCGGAGGCTCGTCGA
GGGTGTTTTGTTGATGTACTGTTCTAGTGGGGGATGGGCGCTCAAAGAAGGCGGATCTCCGGTGCTCCAATCCCCTGCCGTCCCCT CGTCCTTTAAAGAGCTCTTTGTGTCAATCACGCGTTTTTTTCGCCCTCTTTCCCCCCTTCATCGCCATATTGGGCACCGAAAAGCCT CGCCTTGTTATTTCTCTTCCCCCTTTTTTTTTACTACGCGTCTACGCCTCGCAGTTGACAGGAGTGGCCATCGCGAACGCTGCTTTTG TTTTGATGATCGTCTTGTCGATGTTTTTTTCGCTCATGCGGCCCGTCGTTGTGGATCGCGTTGGAGTAGCTCTGTAACAGCTGTGTT TTCGTCTCAAAAATGTCCAATGTTCGCTTGTCTAATGGCAGCCCGACGCTGGAGCGGATGGAGGCGCGACTGTCTGACCAACCGA AGCCGTCGGCATGTCGAAACCTGTTCGGGCCGGTGGATCATGAAGAGCTGAAGAAGGACTTCCAGCGGCAGCTCCGGACGATGG AGGACGCGTCGGCTGAAGCCTGGAACTTCGACTTTTCCACGCACACGCCGCGCGCCGACGGTAGATATCAGTGGGAAGCGCTGGA TATTCGCTCGGTGCCCGGTTTCTACAGCCGATCGGAGCGGGGGAAGGGCTCCGATATTCACATCTCCTCCTCTGGGAATAATAACG ACAATAACGTGGATGTTAACGGGAATCACGACTGTAGGGTAACGGAGCAAAGCGCGGAGACGCCCGAAACGCTCCGAGAGCCGA GGAAAAGAAGCTCCTGTCTCGGTATGTGCTTTGAATTTTGACCGTTAAAAACTTTAAAATGTTGACCGTTGACATTTTAAATCAAA CCGAAAACGGTTTATTTATAGCCTACGTGTGTATGGGTGTATATGATGTGGCTTATGCTCTATATCTCGGAATGTGTTTAACGTTAT TAGTTTTAAGCTTTTCAAACCTACATAACAACTGCGTTGTGCTTGTGACGAACTACGTTTAATTAATACGTTAAATCTACATGTACT ACTTTCAAAACTAAAATGGCTGTATTTTAAATTAGTTGTTTTAACTTTTGTTAACTCAAATATGGACAAGTCCAGCTGTTGCGTTAA GTTTTTCCAGGTAAATTTAAATTACACTTAAAACACAAGCGTTGGGTTTGTGTGTAGTTGACCCACTTGAGTTGTAACTATTTTTAG TGTACAAAAACTAAATTATACATTTCATACGCACTTTTAAGTAGTTGTATTTTGTAGTAAAATGGAGTTTAATCCTTAAAACGATA ATTTATTTAGCTATTTACATGTGTTTTTGTTCTTTTCAACCAGTGTTTGACAATTAAATACTTTTTTTTATTATGTCAGACTCATCGT GTCAAAGCAAACGCTCGCACATCTGTGTGGATGAAGTGACCCGAACGCCCAGAAAACCCAAAAAACCCAGAAAACCATTGAGTC CGACACCCACATAAACACAATGAGGTAAGCACAACATTTTATACTTGAATATTGTGTTATACAGAAAGTTTACAGTTGTTTATTGA TTCTATATAACAGGGGCACATGTCTAAAAAAGAAAGGATGTGTTCTAAAATCTTTAAAAACACTACTCGATTTAACATTAATGTAC CCTAACGTCAACTTAACGGTTATATAAATATAAAACATCCGGCTTTTTCCGTATAATAACCTAAAGAGAGTGCGTGTGTGTGAATG TGAAAGGGTTAAAATGGTGCGTTTACTACGAGAGCTCGAGTTTCCTTCAGAGTGAAAAACATTTTACACGTCAGCAGTGTTCACTA TCGAGGGACTTCAGAGTGTCATTCACACCTCCACTCGACTACTATCATCTGAAACCGCGCATATATAATCACAAGTTCGCGCTAGT ATCCTTTAAGTGCAGGTTTGAGGTGTAAAACCGAACACCTGGAGTCTGATTGCAGGTCGTGTCCGTAAATCTGATGTAACTTCAGG TTGTTGTGTGCTCAGTTTAGTCATGTGAGGAAATGTGCAGCCAAATCGATATGTCAGAGAGCAAATAACAGTCGGTCACGGCGCA TTTATAAAGTCATAACATCAGTAATGAGGAGTGTTTTGCTTTGGTGGGACTCCAAATGTTTCGTGAGCTCATTTTTCCAGTGTTTTT GTTTCCTGCTGTAGTTTCATTCAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGGTGGGTTGTGCTGCTAGTTTGGTTTGTGGTGAAGTCGAGTCAG AAGTGAAGTTATCTGCAAGAGTCAACAGTTTTATTGCTGTTTGTTTATACGTATGTGTAAAATGAAGTTAAGATGAAGTAATAATC ATTCTGAAGTAAATTAATAATGGACTGATCAAATATTTGAAGCTATAAATAGGCCTGAATGTAAAGATTATTTCAGTGTGTTGCGC AAGAGTTCAGTTTTTGTATTTTAGATTGTCATATTTAATTTATTAAGTTAAATGTGTCCTTAAAGTGTTGCATAACTTTTAATGGCTT GTTTTTAGCTCATTTTAATTCAATAACATTTGAAGAAATGTGTGGAAATGCTGATATACAGTAAAAATGTGACATGTTTTTAATAT TGCGTTAATTTGTTAAGCATATATTTATATGTTTAACTTAACATTTGATTGGTGCAAGTTGAGATGACTGAGGTTCATTTAATTTAA CTAAAAATGTTCAGGCAGCAAGATTTTTGTTTATTTAGTTTTGTAGATTTCATTTTAATCTGTTTTACATTGGATTAAATTTGAAATT GTGAAGTTATAAGTTGAATAATGGAGTTTGTGTAATAAAAAAAATCTGTTGTGAGTTATTTTAGTTATATAATTATTATATATAAC AAAGATAAACGTTTATAGGCTACTTTTAAATAAAACAAGAAAAAATAAAATGAAATATTTCTAAAAGTTTAGTTTGGGCTTGCTG CCAAGAAATAACGTCACTTAAAATAAAAATAAAAAATACAGACAGAGTTGCATCTTTAAAAAAGTGAACCCAAAAATAAGCAAA ACGCGCAACAAAAACTCAAACTACAATGAAAACTTGTGTCTGTAGATGTCAGAGTAAAGCTGAAATACACTGAAATCTGACAGTG TGTTTATATTGCTTTAGTTAAATTTATTCATATACACTTAACTTGACATTTGATCGGTGTAAGTTGAGATGACTAAAGATAATTTAA TTTAACATAAAACATTGAAGCAGCAAGATTTTCCTATTTTGTTTTGGAGAGTTTACTCAGTTTTTACATCGGATTAAATACAAAATT GTGAAGTTATAAGTTGAATATTGGCGTTTGTTAAATTAGAAAAAAATCCATTATTCCAGATCTTGTATTTAAAAATGTAATGTTCA ATCTGTTGTGAATTATTGTAGTTAATCAAGGTAAATGTTTATATGCTACATAAAACAAACAACAAGAAATACAATTATATATTTGT GAAAGTTTCATTTGGGCTAGTTGCTCTCAAAAAATGACTTTTGCTACTTTTGTTTAAACGACTTCTTTTGAGTTGATACAACACAAT TCTTAAGGGTTTTTTGAGGGACAACTTAATTGTTTTATGTTCAATCCAGTTAAATTTAGAAAAAAACAATTAAGGTAACGTTTTGG GACAATATGACGGAAATTTGTGGAATTCAGTATTGTTTACAGTGTGCCAAGAAATAACTTTTCTTTTGGTCTGTATTTTCACTTAAA GTTAAGTGGCTCCTTTAAAAAAAAAAAAATAACCAAAAATGCTGAAGCATGCAACAAAAATTCTAACTATAGTTAAAAAAAGAT TAATGTACTCTAAAATATCTGTCAATTTTACATTTAAAACCAAATGTCTAAGTAATCTTTTTCTATGTGGTGTTTATATCTTGCATTT AACACTTACTAATTCTCTGTAATGTTTCCCGACAGGCCTGAAGATGTCGTCATTGTCGTCGCTTCGATGACCTCAGTGCCTGGTGG CTGATTTTTCTATATATTTTGTTTGGGCGTCTGAAAAACAGAGGAGCGAGGAGGGGGAATAAAGAGACATATCAACTCTACGAGT GTGTTCAAGCACTGAATCAGAAACACTAAAAACTTCTGGCACTCAACAATAAAGCAACTGCCTCTGAGAGCAGTTAATGTAGCAG TGTGCAATTAGGTTGAATTTCCTTTTTTGCTCATATATTTTGTTTTCTTACTACCTGTGTATATACATTGTTTCCTTTTTCCCTTATGT AGCACATAATTAGTATTATGTTGTAAAAATGAAAGATTAAAAAAAAAAAAGTATATTGTTTTATTTTTGGAGGTGTGATTTTGGTT TGACTTGAAGAGCCACCGTTGTTGCCGTGTGTAGATTATTTCCAAAATGCTGTTCATTATTGTTTGTGTTGCATTTAATTTGCATAT TGGTTGTGTAGTAAATTTATATTTGGTACACATAAAAAAGCACCGTTTTTGTTTTGGATGTGAACATCTCAGTCTGTTTTAATTGTT AAAATCTCAAACTCTGAGGTCAAACCTTGTAGCATCGACCAGTATTACTATCAGGCACTT/ATCCC CCATGGAGCGTCTCGCGCCCTCTTAAATTATTTCTGTAAGAAGTTTTCTTGATCATCTGTAATTTTTGCGTGAGTTTTTT ... - Additional Sequence
- None
Fish
Supplemental Information
- Genotyping protocol
- None