Genomic Feature

pc45

ID
ZDB-ALT-230404-3
Name
pc45
Synonyms
  • 9ex (1)
Affected Genomic Region
Construct
None
Type
Allele with one delins (1)
Protocol
embryos treated with
Lab of Origin
Peter Currie Lab
Current Source
Other Pages
Notes
Comment Citation
Homozygotes do not survive past 11 dpf. Berger et al., 2022
Genome Browser
Variants
Variant Type
Delins
Variant Location
Chr 17: 28707198 - 28730713 (GRCz11) (1) Details
Nucleotide change
CCCAGAGGCAGCAGCAGCAGCCCGCACCGCAGCAGGGCAACAACAGCATTAATCCTCAGATGAACAGCGCTGGAGGAGCGCCTATGGTTCAGCAACAGCAAGACGAGATGCCCAGGCCCCAGCAGTACACCATCCCGGGGATTTTACACTACATCCAGCACGAATGGGCCCGTTTCGAGATGGAAAGGGCGCATTGGGAAGTGGAGAGGGCCGAGCTCCAGGTAACGTTGTAGACTTTTGGATTTTGCTGACACACTGATTGGAAACCCCAAATCGGGGCATCGACCGACAACTCGTCGGTTGCTTTAATTAAAAGCTTGAGGCTGAATTGCTAAGCATTTTACCATACATCTCGCAAGCTTCCTGTCCACCCTGTTTACACAAAATTTCAACACTAGCAGTTGTGTCAATAAACAAACCTTTCTTCATTTGAAACATGCGAGACATATGTATTTAGCATGCCTATATTGTAAAACAGCAATCTAGTAAGTCGAGTCGCTCACTCGTTCCTAGTGTGGATGTGCTAAGCTAAGCTAACATGACATCGCTGTATTGGCGATAATACGCGACACCCGCTACGATGGATTCAGATTATCTTACCCACGATCACAGAAGCAGATCTAATAGTTGTTTGTTGCGGATTTATTGTGTCACGGGACGCATCTGTCAATGAAAGCCAGCAGACTTTGTCAACTATTCTCTTGTTCTGCCATTTTGTTTTGGTCAATATGGCGTCCGTATGGGTCGCTTTTTTTATTGATCCATCTACTGGGGCTCACTTTCACACCCTGCTTCAATTTTAGTATGTTTTACACACTGCATCTTTTATAAGATTCAAAAGAACATTAAGGGCTTTCTGATCAGCAAAAACTAGTTATCATAAAAATGCTGGATGACAGCGACGGTCACTATTTACGTTCGTTAATGGGACATAACGTTGCATTTAAAGGGAATAGAGTTTAAGGCGAGTTGCGAACACTCTGACTGATATCTGTACTTGTGTTACACATATGACAAACAAACTGTGTTAAACCGGTTTGGAACAACACGAGGGTGTGTAAATGATGACACTGTTCATTTTAGGTTCACTCTCCTTTAAGATCGCTATGAGCAGATAGACTTACTAGTTTAGCTCCTGGTCAGATCAGTATTTTGGATGAATCATTGGCATTTGGATAAGTCTCTTGTCACTATCTTTTTTGTCATTATTTACTCACCCCTATGTTAATCTCCACCTGTATGACAGACTTTGTATAACACAAAAACACAACACGTTTGACAGAATAACAAACCTTTTAACAGTTGACCTGCATTTGTATTTAGAAAATACCTTTATCAGTTAAATAGTTTGTTTCATGGAGGTGCAGCACACAACATTTAGACAATATTGTTGTTTTTGGCAGTCAAATAATTAACAGGTAACATTCAGTAACGTTTACTTGAGTAAATTATAACCATGGTTTTATTGTTGAAAAAGTGTCATCACCACGTTTTTGTTGCATTGATTACATTTGCATAACTAAAGTTTTACTTCAAAGACTATGGTTAAACTATGGCTTAACCAGTTTCCATGGTTTTCAGTTTTGTTAGTAAAAAAAAAAGAAGTGTCCGCTTGTTCTTAAAGTATTTTATTTAAAGTTCTGTCATCCTTTGTTCATCTCCTTTTTTTAAACATATTAAGAGTTTCTTTATGTGGAGGCGCAAGCTATTTTGATAAATGTTTTTGTTTTTTTTGCCTATGAAGAATAATGGAAACCGAATGAGTGATGACTGATTTACCAACAAACATTGTCTGTCCTTTTTTCCCCCCATGACTTTTGTATTTTTTGCTCGCCTCTCACTTTGACAGATTTATTTTTGGGTGAAAGAGTGTGTTATGACAGCCAAATCTCCATTCTCCCCGTATTAATGGGTGTAGCTGTCATATTTTCAGCCTACTAGAGATGTGGATGGCAGTGTAGCTTTTGTGAATGAGGAAAGGAGCTGGCAGGACTTGGCATTATGTAAACACAGTCAGTCTTCATTTCAGAGGCTGAGGAGTCTCTTCACTACCCCTGTACAGACTTGTTTTGTGACATACTTTCAGAATGACTCCCACCTCAAAACTAATGTGCACTTTTCATTAGAGGAAGTCAGCCCTCCCACACTCATACCGATGCAGGTCCTAAAAAGAGGGTTGGTCTTGTTTATTTGCTTTGCATTCCATATTTCCGAGGTTCACTTGCCATCTAACCATTAGACGCATACCGTACATACCACAAACGAAATGCTGCAAGTTGAACCAAATCAAATCATGCTGCCAAATATGAGCGCTTTGATTCTCCAGCTTTGCATGCAGATGCTTAAGTCCATTATCAGGTGCTGCTTTTCAGTGCTGGAGACGTTGCTAATGTTATAATGGATAGTGGTTCTGTGCTACTCTGATAGTGTCTGGATCTAATTGATGTGAAACTCTTCCTGTCAGCTTGCTTGGCTAGTAGGCATAGCTCTTAGCAGAGATGTCCTGAGCAGTCACATCAGGAACGGGCCTGATTGCTGTTATCTGGGTTAGCTCAGGGTTTGTAGGTCATGCTAGCACCATCTTCATAGTCATAATGGCTCATTGCACATCTCTAACCAATCCTACATTTGAAACTTTTTTGAATGTCTGTAAATCCTCTTCTCTTTCAAATGGTGAGATACCCAATTTACAGGTCATACTACTGAATTCTACGTATGAATGACTTCCTAGGTCATCTGTGAAAGTATATAGATAGAAGTATTATTTGAGGGACTTTTATGTTGGAAAATCAAAACGATGCTACGTTTTCATACAGTCTCAAGAGTCCCAAACGTCATTGTTCTCTTCATGATAATGCCGAAAAGAGCTGTTTTCTACTGTAAGGTTCAATTTGTTAGGCAATGAAAATAACGTATGTATATCTGTTGTCATGATGCACTAAATTCCACAACTTGTGCAGGCCGCTAGTCTTGGGACGATAACCGTTTTCAAGGTATACAGAGGTTTGGAAAAGTGAAGGTTGTAAAACCCCCAACATTTCCTGTTATACCATTCCTAAAGTATGTGTAAGATTTTTTTATTTATTTTTTTTTTTTGGTATCCAAAGATGGCGTATTAAATTGTAAAGAAATCTGTGTTTAAAAAACAAATGAAGACTGCAAATACCAGTGATTCATTTGAATCATTTAGCCTTACATGTTTATTGCTTTGAAATATTTTAAATGTTTTCTAAAATAAAGTAGATTGTGTTAAGAAGGGATAAACATTTTTTTTTTACCCAGACATTTAAAAATATTTTATTTTAGAGCCGTAATCACAATATCGTGAAGCCGTGATATTTTTATCCAAGGTTATCGTACCATCAGTCTTATACCGTCCTATACTCACAGGCTGCCAATTTGAAAAGTATTTTAAAATGTTGTAAATTTGTCAACAAATAAGGGAAGAAGACACCCAGAGGTGATATGAACGTGGAGCTGCTTATTGCACTGGTGAACAATAATCATTACTTCATCGCTAGAGCTGGAGCTGCTGCTTGAACCATCCATGCGTGTTCAAATCGCCAGTAACTTTAACAACAAGCGTGTCAACTTTCTGTTTTCTTCTGTGTTACAAGCGTGTGTCAGAAGCTTAAAGATTTTTTGCTCCATCTAACGTCAAGGAGTGATTTTGCATACGCTTGTGCTCCACGCCAGTGAAAATTGCTTGGGTTTGAATCCGGAAAAACGTCTAAAATGATGACTATAAACACAAAAGAAAAGCGTTCTGGTGTGTACCAGCCTTAACGCATGTGATTAAGCAAAACATTTTAAGATATACATTCTTTTTTAATGCAAATGAATTGTTTAATAAGGTTTGACCTGAACTTTTTTGGCCGTCATCACAGCCATATCATTGTGTGATAAGAGTACAGTGAACGCCAGTAATTTGATGGCTCAGGACACAACACGTAGTGTGCTGAATGGCAAGTTTTGTAATAAAAAGCTTCCGGTTGGAAGCTTGGATAAAACCAAAGTTGTGTGCACTTACTGTACTGATGAACTGTCCTTCCACGGAGGGTGCTTTCATACTTGGGTCGATTGCCTAGTCCGAACCCAAGTTTGATTGTCCCCCCCCTTGCCACCTTCTCGGCTGGTTTTTGTTCACATTGTCGTTTTTCCTTCTGAACCCAGGCAACAAAAGCTAAGGCGCCAAAATGGAAAGATGTACACACATTGCGATCGTTCTGCTTTAACTCAATCTTTTGGGTTTGGTAACATACAGAGAGTGACTTGTGTCTATCTGACGCAAACATATTAAATAAGTTCAAAACATAATGCAATGTCAACAGAAGTCGTTTTTGGTGGAGACAAGCAGATGTTTTCACTGTGTTTGTCCTGGCTCAGTCCTGCTTTTCACCAAGGTACAGTAGGGGATACACAGACATACACATGAATGAACGTTATGAAAACTAAAGTTTGTTGTACAGTTGAACTGTACCAGAGTTCGCACTAACCGTACCCCGGACCACTTCTTTTAGGCGGACTCGGGAATGATTCAGTGACAGTTGCGCACCCGAATTCAGAAGAAATTGTTTACACTTGCTAAATGTACATAATTCTGACGTGAAATAAACCCGAGTGTTGACCAGAAGGGCTAATGTGAAAGCACCCTGAAACAACATATCATCTTCAGGCCAAATATATTTTTGCAGATATTAGTAAAGATCTCATTGCTGAGACACAGTAGATGAGTACAGCAGCACAGGTTCATTAACATTAACTAGACTAATATTCACAGACTGCAGACCAATCAACAATGTTTAGGAACATACCAGTTATCTTCTAGGATAGGGATGCCCAAACTAGGGCCAGTGGGCCAAAGTTGGCCCACAGTAACCCTTGATTTGGCCTACCATCCCATCTGAGAAGAGAGGAAGACTGATGTTTGTTTGTTTTATTGTTAACAGCTAACTGAAATGAAATGTTTCAATTAAATGGTGTAAATTTAGTTTAAATGT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Variant Notes
None
Effect on DNA/cDNA, transcript, protein (from publications)
DNA/cDNA Change
35 bp inserted / 23516 bp deleted (1)
Transcript Consequence
None
Protein Consequence
None
Sequences
Flanking Sequence
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