Genomic Feature

bns399

ID
ZDB-ALT-210518-2
Name
bns399
Synonyms
None
Affected Genomic Region
Construct
None
Type
Allele with one deletion (1)
Protocol
embryos treated with
Lab of Origin
Stainier Lab
Current Source
Other Pages
Notes
No data available
Genome Browser
Variants
Variant Type
Small Deletion
Variant Location
Chr 5: 479892 - 496598 (GRCz11) (1) Details
Nucleotide change
TACAGGAGGTCGGGTTCCCCTGCGCTGAGGCTGAATGCTGACTTTCTCCTGCGGCTCTAATGACACAGGAGGGCTCAGATTGTTCAGTCTTCCTCATCCTCAGCACAGAGACAGGAAACAGGAAAAGGAACTGCACTCCCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGGGTGGAGGAGCGCAGGCAGAAAGCGAGAGTTGAGTGTGTTTCTGTGATGAACAGAGGATCATCATGTGTCTGCTGGACTCCTGCACTGCTCTGCTGCTGCTCGGCTGCTGGATGTCAGGTACACTGCTCCACCTGTTCCTCTGCTCACCTCAGTACTCTGATCTGTCATGATGATGATGATGATGATGAAAACAGCCCAATCGCCAGTGTGGGTTCACAGTGAGAGTTATTCTGCCGGTGTTTCTCCATCAGTGTGTGTTCTTCACGATAGAGGAACGACTTCACTAACTCTCTGCTCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTATGTGTGTGCGTGTGTGTATTTCTCAGCATGTTTGAGTGAGTATATTTCTGGGTGTGTGTGTGTGTTTCTGTGTGTATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTTCTCAGCATGTTTGAGTATGTTTCTGGGTGTGTGTGTGTGTTTCTGTGTGTTTGTATGTGTGTGCGTGTGTGTATTTCTCAGCATGTTTGAGTGAGTATGTTTCTGGGTGTGTGTGTGTGTTTCTGTGTGTATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTTCTCAGCATGTTTGAGTATGTTTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTATGTGTGTGCGTGTGTGTATTTCTCAGCATGTTTGAGTGAGTATGTTTCTGGGTGTGTGTGTGTGTTTCTGTGTGTTTGTATGTGTGTGCGTGTGTGTATTTCTCAGCATGTTTGAGTGAGTATGTTTCTGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTCTGTGTGCGTGTGTTTCTGTGTGCGTGTGTGTATTTCTCAGCATGTTTGAGTGAGTATGTTTCTGGGTGTGTGTGTGTGTTTCTGTGTGCGTGTGTGTATTTCTCAGCATGTTTGAGTGAGTATGTTTCTGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTCTGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTTTCTGGGTGTGTGTGTGTGTGACCACCTACATGTCTTCCTCTGTTTCTTGCAGTATGGCTCTGGTCCAGTTATAATAAACAGTCTTCTGTGTGAGTTTGTGTCGTGATAGAGGACGCTCCTCAGTGTGTGAATGCTCCACTGTTGGAACTTAACATCAGGGATGTTAGATTAACTCAGTAATGCCGTCTCCTCATAATTATTCCCTCAGCAATGATAAGAACACATTGAAGAGTCACGAAACACCAGAACACGTGTGTTGAGCTGTAGACAGTCGTACATGTGTCCCACGCTGCTAAAACACTATGAGGACACGTATATCTCACTAACAGGTGAAAATTGGTTGTTTTTGCGTTATTTCCAGCAAATTCATTCTTCTGGTTTGAAGTAAATGTTAAAGCTGCGTCACAGCGATTAGATCCTTGTGTAAATCCCGCCATTGAGACTGGATGTCTGTACCGGCGAGAGTGTTCAGCTTTAACTCATGAGAAAGATTTGCTTCACCTGAGAGCTTTTCTCATCTGGAAATGGTGAAATCCGGATAAGCCGCTCGTCTCCTTTTAATAAAGAAGCAGCTCCAGTTGGTGTTGATTGTTCTGTCTCTACACATTATGGCCCTCGGCTATAATGATCTCTTATGATGATCTCAGTTATGAGGATCTATGGCCCAAACTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTGAACAGCATTAGTAAACACACACACGTCAGATTCTCACTGATGATGGCAGATGAAGATGAGCATCTCGGACGATCAGTCTACCAGCAAAGAAACCGTCGATATACAATAAATACAAAATAAATAGGGCTGTCAACATTAGCGCGTGATTAATTTTAAATATTTAACACGTAAAAAATTACGCAAATAAAGCTGTTGCAGATTTTTTTTAATTTGCTGTTGTGGCCGACGTGTGTTCAGGGATGGCGCGTGCATAGAGGCGATCTAGGCGGTCGCCTTGGGCTGCAGAATAGTGAGCGAACCCCCCGGTCTTAACTTTCATATGTGAACCGGTCACTTCCGGGTTGAGGGCGGTGTGATCGCCGTTTGCCTCGAGCGCCAGTTCAGCTTGATTCAGCCCTGCATGTGTTTAACGTGCAAAGAAATTTGGATAAGACCAAGGAAACACTTTTAAAAGGAAAGTTTCAGTATGAAACAATTAATCACGCATCAGACAGAGGGATTGACACGGTACTGGCCCAAGGACCAGCTGGACAAGAGCAACCTGTGGTATTCCTGAGTCGGAAGCTGTTGCCCAGGAAGACTCAATACTCTACTATAGAGGAGTGTCTCCGCTTCTGCCTCCAGCGGCAGGAGTCTGACCATCAGGCACTTACCTGGATTAACTCCATGACAGATACTAACGCCAGAGTGACCCGGTGATGCCTGACACAGCCCTTCTAATTCCAGATAACTGATTGCCCTGGAAGGGAAAATTTAGTAGAGCAGTGGTTCTCAAACTGTGGTACGCAGGCTTCCTTCTAGTGGTATGCGGAGGAATGAAATATGTCAAGTACATGCTACACACATTTCAAAATTTACCAAAAACTATGTATATAATGTGCCATATATGACATATAGCCTATATTTCTGAGGTAATGTGCCACGTTTTTTTTAACAGTGTAGAGTTGTAGCTGCTTTACTGGGCCTACGCTACTGTATTTCAATACTGCTCATTTTGGTGGTACTTGGAGAGACAAATAGTTTCTGAGGTGGTACTTGATGAAAAAAGTTTGAGAACCACTGTAGTAGAGTAACTTCTTGTCGAGGTTCCCTGACACTACGTGGCTAGGAGAGGGAGAGGATAATGTGAAGAAGTGAGCCTTCTTCCCTCCATCTTGATCATGGATCATCATGCCTGCATTGGTACACACACACTTACATAGCCACTTACCTGTACTTTTCCCTTCCGTTCGCTGCAGATGCAGAGTGTACACGTCATCTTACAGCATCCAGTCATTCCCTTCACTTCTCCATCTGTCCTCTGTTTACACTGAGCACACATTCACACACACCTAGTCTTCGTGTCTTTGTTGGACTTCAGAGCTGGGCCGGCCAAACCAAGTTCAGAGCTGGCGCCGGCTAATGACATCACAAGCCGCGCCATGGCAGCACCATGCACTGAAGCTCCAACCGTACCATTGTGTTTGGGTACAGCCACCGCAGCTGATCGTCCTGTATGAGGAGAGAATGTTCATCTAATCAATATTCTGTGTTTGTGTTGTGTTTGAGTCATTAGGTTGAGGTTTATGCCGCAAAGGCAATACTTACCTATTATTGGTATGGCTTAATCAAGCAGACACCAGACTGGAGATCTTGGTCAGAGCATGTTGTGGCAGATCTGTGAGCAGTTCTCTTGTGTTGGATCCTCTATTATATATTGTGAATATAGTGTTTGTTTATTTTTGGAGTTGTATATAAGTCTATGATGATGATGATGATGAAGCTTTATTTGTCTCATACACTTTCATGCAGCCAAATTGAACAGGGAATAGTCAACTGTCTGGGATTAGTTAAGCGTAGGGGCCGTAAGGGGCTGTAACACTCCAAGAGCTCCTCAAATACTAAAGCTCAGCTGTTCAGGGCTTTCAGTGCTGACAGAACCGTTCTGATATGATCATATCTCCACCCAATAGTCCAGCACTGTGGTCATGGAAGGTTCTGTTCGGTGTAAAGATCATCACGCGTCCCTGTAAACCACCTAGTCTGTGTTTCCTCAGTGAATGAAGGTGATCAGTGTGTGCTGTGTTTGCAGGCAGTGCAGTCCGCATCTCAGACGTGACTCTGGTGAACCCTGACCCGGTGGTGTCGCCTCTGACCGCTCCATCTCTCCTGTGTGTCAGCAGTGACTGGAGCTCCGGCGGGTCAGTGCTGGCTCTGGGTCAGGAGTTCCCCCGTCCACAGGGGTCAGTGCTGGCTCTGGGTCAGGAGTTCCCCCATACGGAGCCCCGCCCACACCCCGCCGCCGCTACCGTCACCTGGAGCTCCCGCAGCCACGCATTCGGGGCCTTCTACTGCCAGATCAGAAACTCTACTGGCAGAAAAATCTACACCTACAAGATGCTACAGGAAGGTACCGACCGCCGCTAATAACTGATGATCACAGCTCACCTTAGCAGACACGCTTTCACTGCTTCTGCTTCCTCCAGCTGCGTTCCTGCCCGAGTCTCTGACCATCACCGTGAACCAGGGAGAGAACATCAACATCTCCTACAGCAGGAGGCTGTACTCGCCTGAGGACACGGTCATACATAAAAACGGTGAGGGGCGCGTGTGTGGAGCGAACACTGATGAACACACACACACACACACACACACTTATGCTCTGTTCAGGTGTGAGCGCAGATTCAGATGCTCAGTTCTGCAGCTGCTGCTCTCTGTTGTGTTTTCTTCAGGTCATTTCGAACACTCGTCCCCTAAAGAGGACATCTCAGACATCATCCACTACCCAGTGACCAACGCTAAAGCTGAGAGTCACGCGGGAATATATGCTATACGCTACATCTCTGCAGCGCCGTCCAGCGCCGCTATCACACGGCTGATCGTCAGGAGTGAGTCTGCACACACACACATCATCATCACTGAACACACACACACACACACATCATCATCACTGAACACACACTCATCTGGGTTTTATTAATATGTGGTCTATAAATAAGCAGAACTAACCAT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Variant Notes
None
Effect on DNA/cDNA, transcript, protein (from publications)
DNA/cDNA Change
16707 bp deleted (1)
Transcript Consequence
None
Protein Consequence
None
Sequences
Flanking Sequence
ACACACATTTGTTTTTGTGAAAAGTGGGGACATTACATAAGTTTCCATTCATTTTATTCTGTCCAAACCGTATATTATATTGCCCTAAACCCAACCATCACAGGAGTCAGTGTGCAGCTTTACTCTGATTAAACTCATCCTGTGGGATTTATTAGCATTTTGAGAAACGAGGACGTCACCAATGTCCCCATACGTCACCTGCTTTTTGCAATACCTGTGTCATACCCATGTCATTATACAGATTTGTGTCCTGATATGTCAGAAACACACACTCGTGTCCAGGTTATAGTTGTCATGAGTGTCCAGAACTGAAGTAGTGTTGATGATCAGTTTATATAGTCATTAATGGCCGGTAAGTACCCCGCTGGAGGCTCTACACACTCGCGCCGCTTCCTCTGAGGACACACTGAAACTGCCTCTGATTATCTGTTGTGTTTCAGACCTGACATCAGAGATCATTCAGGCTGAACACATCTGTAGGTCCACCCTGCAGGCTGGGT
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None
Fish
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None
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