Transcript

appa-203

ID
ZDB-TSCRIPT-141209-214
Name
appa-203 Nomenclature History
Previous Names
  • appa-001
Transcript Type
mRNA
Annotation Status
Annotation Method
Ensembl
Associated With Genes
Strain
TU
Non Reference Strain
Genome Resources
RNA Central
None
Note
None
Sequence
ENSDART00000167331 (1) [ Show ] (double-click sequence to select) [Download]
>tpe|ENSDART00000167331.2|gene_biotype:protein_coding|ENSDARG00000104279.2 transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:appa cdna chromosome:GRCz11:1:617620:625875:-1
GTAGAGCTGCTGCAGCGTGAGCAGCAGGAGATGTCCGCTC
AGTTGGCGAATCTGCAGAGTGACGCGCGTGTGAGTTATGG
GAACGATGCGCTGATGCCCGACAGCACCGCCGGCCTGGAG
CTGCTGCCCGCCGAGGACACACAGGGGTTCGGCTTCATAC
ACCCCGAGAGCTTCAACCAGCCCAACACACACAACCAGGT
TGAGCCTGTCGATGCCCGACCTGTTCCAGACCTAGACCTG
GCAACCCGACCAGTGTCTGGACTGAAGCCTGATGACATTC
CTGAGCTGCGGATGGAAGCTGAAGAGAGACACAGTGAAGT
CTACCACCAGAAGCTGGTTTTCTTTGCGGAGGACGTGAGC
TCCAATAAAGGAGCTATTATTGGCCTGATGGTCGGAGGCG
TCGTCATAGCAACCATCATCGTCATCACGCTGGTGATGCT
GAGGAAGAAGCAGTACACGTCCATCCACCACGGCATCATC
GAGGTGGACGCGGCCGTGACTCCAGAGGAGCGTCATCTGT
CTAAGATGCAGCAGAACGGCTATGAAAACCCCACCTACAA
GTTCTTTGAGCAGATGCACAACTGATGGAGCACCGTCACC
CCTAACCCTCCCCGAACCCTCCCCGAACCCTCCTCAGACG
GTGCAGGAGATGCCAGAACATCAACAAACATCACCGTTGG
CCAGATCACGGTCAGAAATGAGCAATCAGAGTGAACACAT
AGTTCAGATTCAATTCAAATCACTGGTCAAAGTGAACACA
ATTTAGATTCAGTCCAAATTACTGGCCAAAGTGAACACAC
AATTCAGATTCAGTTTAAGTTCATGCATAATGCAAATTTC
AGTAGGATTCACATTTTATTGAATGCCTAATTCATATTTA
GTCCAAATTCATATTACAAAACAAACACATAAATCTGATT
CACTTTAAATCGCTGGCCATAGTGAACACAAAATTCAAAT
TCAATCCAAATCACTGGCAAAAGTGAACACAAAATTCAGA
TTCAGACTAAATCATTTTCCAAAGTGAACACATAATTCAG
ATTCTGTCCAAATCACAAGCCAATATAATCACATAATTTA
GATTCAGTTCAAATCACTGGCCAAAGTGAACACAAAATTA
GATTCAGTTCAAATCACTGCCCAATTTAAACACACAAATC
AGATCCAATTCAATTCTCTGGCCAAAGTGAACACAGAATT
CAGATTCAATTCAATTCTCTGGCCAAAGTGAACACACTAT
TCAGATTCAATTCAATTCTCTGGCCAAAGTGAACACACTA
TTCAGATTCAATTCAATTCTCTTGCTAAAGTGAACACACA
ATTCAGATTCAGTTCAAATCACTGGCCAAAGTGAACACAC
AATTCAGATTCAGTCTAAATCACCAGCCAATATAATCACA
TAAAATAGATTCAGTCCAAATCACTGGCCAAATTGAACGC
AATATTCAGATCCAATTAAAACCCCTGGCCAACGTAAATA
AACAATTCATATTCAATTTAAATCACTGGTCAATGTAAAC
ACAAAACTCAGATTAAATCCAAATCACTGATAATATTCCT
CTGCTACAGTAGGCCAGTCCAGGTTCTGGTGTATTCTGGG
CTGGTTCTGGTGTTTTCTGCACCGTCTGCTCTCACACTAC
TAAACGAGTGAAACACTGGTGTATTTGAGGGCTGAACGTG
CGAGACTTCCTCCGTCAGTCGCGTCTCCTTCCTCTTCCTC
CTCACACTGACTGCAGCTGTGCTGTGTTTGGTGACGCCGG
TCATAGACCAGAAAATCACTATAAATCTAGTGCTTACATT
GATGTCCTTCTGAATGAGACCTGGAAATTGTTTGATTGTT
TCTGATTTGTTTTTCCAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAATT
TTGCCAAAAAAAAAACAAACAAACATTTTTTTAGTTTGTG
AATATTGAAGTAACGCAAAAAGAAAGACTAGCTGTAACTG
TGTAGTGCATGATAGAAAACAAAAACTGACGGGAAATACA
TGCTATTTGGGTCTTTTCTCACGTAGAGGCGTGTTAGCAG
GGTTAAACTGTACAACTTGTGAAATGTGATTTGAGTTGCA
CAAGAAAAGAGAACTCGATTGGCTTCTGCTTTGATAGTTT
TAAGCTGGATTAAACGGATTCGTGCTTTTATTTCAATATC
ATTTCTAGTTGTTGTTTTTTTATCAGGCTGAGTGGATCCA
GCCGAAGCTGTCCATGTACATTTACTGTCTTCAATGTTTT
CGTCCTATGCATTTCGAGAGATTTATTTACCTCCTCTTTA
TGAACAGCTATTTAATTTCCGTTCTCCATTGGACTCGTGG
TTGTCTGTGTTTTTTAAGCAGGTGTTGGGCTCGGGTGGGA
TTGTGGGTTATTCTGTGTATGTTTGTATGTTTTTCTCCAG
TCGGTTTTGTGTTGGTTCGTCACTCCATGTGTGTGTGCGT
GTGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
GTGTGTGCGCGCAGATGTAAAAATCTCCCGTTTCTGGTGT
TTCACTGCAGAAACAGATCCTGCTGCATTCAAACCACTGC
AAAATCACAAGAAATCTGTTTCATTTAATTACGTTTTAAT
TATTTTGTGCATTGCAATTTTTTATTTGACTTCAGGTTGT
TGTAACTGCAATGAAACTAAAATATGATTTCAAGTATTTA
TCATAGTTGCATTTGTGCTGAATGTAATTAATGCATTTTA
TTAGCCGGGTCCAGACTTTTTTTTTACTGCATTACATTAC
TCGACTTAAAGTGGTCATGTGATACTTTCTTAATTAATTA
ATGTGAATATATTTATATTTATAAACCATATTTATACATC
AAAACAAATCATAAATAACATATAATCCACTATTTTCTGT
CCCCATTTTTGACTCTCATCAGAACACACAGTTTGAGTGG
GCGGAGCCAACATACTCTGTAGTAAACACCTACTGCTCTG
ATTGGCTGAGAGTTTTGCATATTAACAAGATTCAACATGC
AGTGATGTAGAAGTGGGATTGGCTGATGGTTTTGCATATT
TACAAGGCTCAGCAGGCTGTGAAGTAGAAGTGGGCGTGGC
TTATCCACCCTATTACATCACATAAAATACAACATTGCAG
TGGTTTTGTCTGGAGGCTTCAATATATTTCAAGTATTTAT
CATGGTTGGTTGCATTTGTGCTGAATATTAATTAATGCGT
TATTATTAATCATGTCTAGAGATATTATTTTTATTGCTGC
ATTACAGTCATGCAGATCTGTTTAAATTGGTCATGTGATA
CTTTTTTAATTAATTAATGTTTTTATTTTACATTATTCTC
TGAGCTCCACTTATCATATCATCAATATTTATACATCAAA
ACACAATCATATTTACAAATAATCAAATTTTCTGTCCCCA
TTTTTGACTCTTATCAGAACACACAGTTTCAGTGGGCGTG
GCCAACTGTCGACTCAGAAGGGAACACCCACTGCTGTGAT
TGGCTAACAGTTTTGCATAATAACAAGGCTCAGCTTGCAG
TGATGGATATAGAAGTGGGATTGGCTGACAGTTTTGCATA
TTAACAAGGCTCAGCAGGCAATGAAATAGAAGTGGGCGTG
GCTTATCCACCCTATTACGCCACATAATATACACCATTCC
AGTGGTTTTGTCAGAAATGCTTCAATAGAAGCTGATTTTA
TTTGATTTCTGAAACTTGTGGAATATTGATGAGCTCGTAT
ATAAGCTCAATATATAAAGGGAATTCTGCGTTCTCACTTC
ATGACCTCTTTAACAACGCAAGCCAATATTAGTGGATCAT
TTGTCTTCGTGCTCATGCAAATCTCTTGTGATCTTGTGCT
GAATGTGGTGTGATCTGTCCTGCAGCGTTAAATGATCTTG
TCGTTCGTCTGTTGATCACTCACTCCTCCTCTTGTGTTTT
GTTGTAGACACTTTCTGATTTAAATGATCTACAGATGATC
AATAATAATCGGCTATCTGATGAATGTCAGTGGGAGCAGC
GGTGCATTGTGGGTAATGCTTTGGGTTGCTGTGGTTTGAT
CAGATGTGCTGAAAGATGGCGATAAACTTCTTTTTCTCTG
TCTATCGTTTGCTTTGACTGGAAAACTACTGCGCTTTCTA
CACTGTATTCCATAAATAAAGTTTCGAATGTACATACAGA
CCCACGTTTGGCATGCCTTGTTTGTTTACAGTGCACAAAT
CAGACCTACTCTCAGTTAGAACTGTAAATATTTGGGATTA
TTCAGGTGTTTATTTGATTGAACATGCATCTGAGTTAAAT
ATAAAACTGATATCGGTTCATAAATAAACAAAGGGACAAT
AAAAGCATTTATTAAATAT

OTTDART00000045254 (1) [ Show ] (double-click sequence to select) [Download]
>tpe|OTTDART00000045254|OTTDARG00000032403|ZDB-GENE-000616-13 appa|OTTDARP00000035763 appa-001 LG_ FP067437.2 Danio rerio protein_coding KNOWN, 4339 bp
GTAGAGCTGCTGCAGCGTGAGCAGCAGGAGATGTCCGCTC
AGTTGGCGAATCTGCAGAGTGACGCGCGTGTGAGTTATGG
GAACGATGCGCTGATGCCCGACAGCACCGCCGGCCTGGAG
CTGCTGCCCGCCGAGGACACACAGGGGTTCGGCTTCATAC
ACCCCGAGAGCTTCAACCAGCCCAACACACACAACCAGGT
TGAGCCTGTCGATGCCCGACCTGTTCCAGACCTAGACCTG
GCAACCCGACCAGTGTCTGGACTGAAGCCTGATGACATTC
CTGAGCTGCGGATGGAAGCTGAAGAGAGACACAGTGAAGT
CTACCACCAGAAGCTGGTTTTCTTTGCGGAGGACGTGAGC
TCCAATAAAGGAGCTATTATTGGCCTGATGGTCGGAGGCG
TCGTCATAGCAACCATCATCGTCATCACGCTGGTGATGCT
GAGGAAGAAGCAGTACACGTCCATCCACCACGGCATCATC
GAGGTGGACGCGGCCGTGACTCCAGAGGAGCGTCATCTGT
CTAAGATGCAGCAGAACGGCTATGAAAACCCCACCTACAA
GTTCTTTGAGCAGATGCACAACTGATGGAGCACCGTCACC
CCTAACCCTCCCCGAACCCTCCCCGAACCCTCCTCAGACG
GTGCAGGAGATGCCAGAACATCAACAAACATCACCGTTGG
CCAGATCACGGTCAGAAATGAGCAATCAGAGTGAACACAT
AGTTCAGATTCAATTCAAATCACTGGTCAAAGTGAACACA
ATTTAGATTCAGTCCAAATTACTGGCCAAAGTGAACACAC
AATTCAGATTCAGTTTAAGTTCATGCATAATGCAAATTTC
AGTAGGATTCACATTTTATTGAATGCCTAATTCATATTTA
GTCCAAATTCATATTACAAAACAAACACATAAATCTGATT
CACTTTAAATCGCTGGCCATAGTGAACACAAAATTCAAAT
TCAATCCAAATCACTGGCAAAAGTGAACACAAAATTCAGA
TTCAGACTAAATCATTTTCCAAAGTGAACACATAATTCAG
ATTCTGTCCAAATCACAAGCCAATATAATCACATAATTTA
GATTCAGTTCAAATCACTGGCCAAAGTGAACACAAAATTA
GATTCAGTTCAAATCACTGCCCAATTTAAACACACAAATC
AGATCCAATTCAATTCTCTGGCCAAAGTGAACACAGAATT
CAGATTCAATTCAATTCTCTGGCCAAAGTGAACACACTAT
TCAGATTCAATTCAATTCTCTGGCCAAAGTGAACACACTA
TTCAGATTCAATTCAATTCTCTTGCTAAAGTGAACACACA
ATTCAGATTCAGTTCAAATCACTGGCCAAAGTGAACACAC
AATTCAGATTCAGTCTAAATCACCAGCCAATATAATCACA
TAAAATAGATTCAGTCCAAATCACTGGCCAAATTGAACGC
AATATTCAGATCCAATTAAAACCCCTGGCCAACGTAAATA
AACAATTCATATTCAATTTAAATCACTGGTCAATGTAAAC
ACAAAACTCAGATTAAATCCAAATCACTGATAATATTCCT
CTGCTACAGTAGGCCAGTCCAGGTTCTGGTGTATTCTGGG
CTGGTTCTGGTGTTTTCTGCACCGTCTGCTCTCACACTAC
TAAACGAGTGAAACACTGGTGTATTTGAGGGCTGAACGTG
CGAGACTTCCTCCGTCAGTCGCGTCTCCTTCCTCTTCCTC
CTCACACTGACTGCAGCTGTGCTGTGTTTGGTGACGCCGG
TCATAGACCAGAAAATCACTATAAATCTAGTGCTTACATT
GATGTCCTTCTGAATGAGACCTGGAAATTGTTTGATTGTT
TCTGATTTGTTTTTCCAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAATT
TTGCCAAAAAAAAAACAAACAAACATTTTTTTAGTTTGTG
AATATTGAAGTAACGCAAAAAGAAAGACTAGCTGTAACTG
TGTAGTGCATGATAGAAAACAAAAACTGACGGGAAATACA
TGCTATTTGGGTCTTTTCTCACGTAGAGGCGTGTTAGCAG
GGTTAAACTGTACAACTTGTGAAATGTGATTTGAGTTGCA
CAAGAAAAGAGAACTCGATTGGCTTCTGCTTTGATAGTTT
TAAGCTGGATTAAACGGATTCGTGCTTTTATTTCAATATC
ATTTCTAGTTGTTGTTTTTTTATCAGGCTGAGTGGATCCA
GCCGAAGCTGTCCATGTACATTTACTGTCTTCAATGTTTT
CGTCCTATGCATTTCGAGAGATTTATTTACCTCCTCTTTA
TGAACAGCTATTTAATTTCCGTTCTCCATTGGACTCGTGG
TTGTCTGTGTTTTTTAAGCAGGTGTTGGGCTCGGGTGGGA
TTGTGGGTTATTCTGTGTATGTTTGTATGTTTTTCTCCAG
TCGGTTTTGTGTTGGTTCGTCACTCCATGTGTGTGTGCGT
GTGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
GTGTGTGCGCGCAGATGTAAAAATCTCCCGTTTCTGGTGT
TTCACTGCAGAAACAGATCCTGCTGCATTCAAACCACTGC
AAAATCACAAGAAATCTGTTTCATTTAATTACGTTTTAAT
TATTTTGTGCATTGCAATTTTTTATTTGACTTCAGGTTGT
TGTAACTGCAATGAAACTAAAATATGATTTCAAGTATTTA
TCATAGTTGCATTTGTGCTGAATGTAATTAATGCATTTTA
TTAGCCGGGTCCAGACTTTTTTTTTACTGCATTACATTAC
TCGACTTAAAGTGGTCATGTGATACTTTCTTAATTAATTA
ATGTGAATATATTTATATTTATAAACCATATTTATACATC
AAAACAAATCATAAATAACATATAATCCACTATTTTCTGT
CCCCATTTTTGACTCTCATCAGAACACACAGTTTGAGTGG
GCGGAGCCAACATACTCTGTAGTAAACACCTACTGCTCTG
ATTGGCTGAGAGTTTTGCATATTAACAAGATTCAACATGC
AGTGATGTAGAAGTGGGATTGGCTGATGGTTTTGCATATT
TACAAGGCTCAGCAGGCTGTGAAGTAGAAGTGGGCGTGGC
TTATCCACCCTATTACATCACATAAAATACAACATTGCAG
TGGTTTTGTCTGGAGGCTTCAATATATTTCAAGTATTTAT
CATGGTTGGTTGCATTTGTGCTGAATATTAATTAATGCGT
TATTATTAATCATGTCTAGAGATATTATTTTTATTGCTGC
ATTACAGTCATGCAGATCTGTTTAAATTGGTCATGTGATA
CTTTTTTAATTAATTAATGTTTTTATTTTACATTATTCTC
TGAGCTCCACTTATCATATCATCAATATTTATACATCAAA
ACACAATCATATTTACAAATAATCAAATTTTCTGTCCCCA
TTTTTGACTCTTATCAGAACACACAGTTTCAGTGGGCGTG
GCCAACTGTCGACTCAGAAGGGAACACCCACTGCTGTGAT
TGGCTAACAGTTTTGCATAATAACAAGGCTCAGCTTGCAG
TGATGGATATAGAAGTGGGATTGGCTGACAGTTTTGCATA
TTAACAAGGCTCAGCAGGCAATGAAATAGAAGTGGGCGTG
GCTTATCCACCCTATTACGCCACATAATATACACCATTCC
AGTGGTTTTGTCAGAAATGCTTCAATAGAAGCTGATTTTA
TTTGATTTCTGAAACTTGTGGAATATTGATGAGCTCGTAT
ATAAGCTCAATATATAAAGGGAATTCTGCGTTCTCACTTC
ATGACCTCTTTAACAACGCAAGCCAATATTAGTGGATCAT
TTGTCTTCGTGCTCATGCAAATCTCTTGTGATCTTGTGCT
GAATGTGGTGTGATCTGTCCTGCAGCGTTAAATGATCTTG
TCGTTCGTCTGTTGATCACTCACTCCTCCTCTTGTGTTTT
GTTGTAGACACTTTCTGATTTAAATGATCTACAGATGATC
AATAATAATCGGCTATCTGATGAATGTCAGTGGGAGCAGC
GGTGCATTGTGGGTAATGCTTTGGGTTGCTGTGGTTTGAT
CAGATGTGCTGAAAGATGGCGATAAACTTCTTTTTCTCTG
TCTATCGTTTGCTTTGACTGGAAAACTACTGCGCTTTCTA
CACTGTATTCCATAAATAAAGTTTCGAATGTACATACAGA
CCCACGTTTGGCATGCCTTGTTTGTTTACAGTGCACAAAT
CAGACCTACTCTCAGTTAGAACTGTAAATATTTGGGATTA
TTCAGGTGTTTATTTGATTGAACATGCATCTGAGTTAAAT
ATAAAACTGATATCGGTTCATAAATAAACAAAGGGACAAT
AAAAGCATTTATTAAATAT

Segment Relationships
Protein Products
No data available
Supporting Sequences
Citations