Transcript

vtg6-204

ID
ZDB-TSCRIPT-091110-1475
Name
vtg6-204 Nomenclature History
Previous Names
  • vtg6-001
  • rp71-23d18.1-001
  • rp71-23d18.5-002
  • si:rp71-23d18.1-001
Transcript Type
mRNA
Annotation Status
Annotation Method
Ensembl
Associated With Genes
Strain
TU
Non Reference Strain
Genome Resources
RNA Central
None
Note
None
Sequence
ENSDART00000143443 (1) [ Show ] (double-click sequence to select) [Download]
>tpe|ENSDART00000143443.2|gene_biotype:protein_coding|ENSDARG00000016825.12 transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:vtg6 cdna chromosome:GRCz11:22:24811396:24818066:-1
ACAAACCACCAGCAATGAGAGCTGTTGTGCTTGCCCTGAC
GGTAGCCCTTGTGGCGAGTCAACAGTTCAACCTTGTTCCC
GAGTTTGCCCATGATAAGACCTATGTGTACAAGTATGAGG
CTTTGCTCTTGGGTGGTCTTCCTCAAGAAGGTCTCGCCAG
AGCAGGTATCAAAGTCAGCAGCAAGGTTCGTCTGAGTGCC
ATGACAGAGAACACCTACCTGATGAAGCTTATGGATCCTC
TACTCTACGAGTATGCTGGCACTTGGCCCAAGGATTCATT
TGTTCCTGCCACTAAGCTCACCTCAGCACTGGCTGCTCAG
CTTCAGATTCCTATCAAGTTTGAGTATGCTAATGGTGTGG
TTGGCAAGGTTTTCGCCCCAGCAGGAGTCTCTCCTACTGT
CATGAACTTGCACAGAGGTATCCTCAACATCCTTCAGCTC
AACCTCAAGAAGACGCAGAACATCTACGAGCTGCAAGAGG
CTGGAGCTCAGGGAGTGTGCAGGACACACTATGTCATCAA
TGAAGATCCAAAAACCAACCACATTATTGTCACCAAGTCT
AAGGATCTGAGCCACTGCCAGGAGAGAATCATGAAAGATG
TTGGCTTGGCATACACTGAGAGGTGTGCTGAATGCACAAA
GAGGGTCAAGAGTCTGATTGAAACTGCAACTTATAACTAC
ATCATGAAACCAGCTGACAATGGTGCACTGATCGCTGAGG
CAACAGTTGAGGAAGTGTATCAGTTCTCACCCTTCAATGA
GATCCATGGTGCTGCAATGATGGAAGCAAAACAAACCTTG
GCTTTTGTGGAGATTGAGAAGACCCCTGTTGTTCCAATCA
AAGCTGATTACATGCCCCGTGGATCCCTGCAGTACGAGTT
TGCATCTGAGATTCTTCAGACCCCCATTCAACTCATGAAG
ATCAAAGATGCACCAGCCCAGATTGTCGAGGTCCTGAAGC
ACTTGGTAGAAAACAATAAAGACATGGTCCATGATGATGC
TCCATTCAAGTTTGTACAACTTGTTCAGCTCCTGCGTGTT
GTCACCTTGGACAAAATTGAGGCTATCTGGTCTCAGTTCA
AGGACAAACCAGTTTACAGGCGCTGGCTTCTGGATGCTCT
TCCTGCTGTTGGAACACCAGTCATTATAAAATTTATCAAG
GAGAAGTTCCTGGCTGGTGAATTTACAACTCCTGAGTTCA
TTCAGACTCTTGTGATTGCTCTGCAAATGGTCACTGCTGA
TCTTGAAACCATCCAAATGACAGCTAGTTTGGCTATGCAT
GAGAAATTTGTCTCAATCCCAGCTTTGCGTGAAGTTGTCA
TGCTTGGATATGGTTCCTTGATTGCCAAGCACTGTGTTGC
AGTTCCCACTTGCCCTGCTGAGCTCCTCAGGCCCATTCAT
GAGACTGCCACAGAGGCCATTTCTAAGAATGACATTCCTG
AAATCACTTTGGCTCTGAAAGTTATGGGCAATGCTGGTCA
CCCTTCAAGTCTTAAACCCATCATGAAGCTCCTACCTGGA
CTGAGAACTGCAGCTAATGCTCTGCCCGTTAGAGTCCAGG
TTGATGCCATCTTGGCCCTGAGGAACATTGCCAAGAAAGA
ACCCAAACTGGTTCAGCCTGTTGCCCTGCAGCTTGTTTTG
GACAGGGCTCTCCACCCAGAGGTGCGCATGGTTGCTTGTA
TTGTGCTGTTTGAGACTGAGCCTTCAGTGGCTCTCATCTC
CAGTCTTGCTGGAGCTTTGAGGACTGAGCCAAACATGCAT
GTTGCAAGCTTTGCCTATTCCCACATCAAGTCCTTGACCA
GAATCACTGCTCCTGATATGGCATATGTTGCTGGTGCAGC
TAATGTTGCCATCAAGCTTATGAACTGCAAGCTGGACAGA
CTTAACTACCGTTATAGCAGAGCTTTTCAGATGGACTATT
ATTATACTCCTCTTATGATTGGAGCTGCTGGTAGTGCCTA
TATGATCAATGATGCTGCCACCATCCTGCCCAGAGCTGTT
GTAGCTAAAGCACGTACTTACCTGGCTGGAGCCGCTGCTG
ATGTTGTTGAGTTTGGTGTGAGAACTGGAGGAATCAATGA
GGCTCTTCTAAAATCTCCTGCTGCAGATGAAAGTGTTGAC
CGTATCACAAAGATTAAGCGTACACTGAAAGCACTCACAA
ACTGGAAGGCTTTGCCAACTGATAAACCACTTGCTTCAGC
CTATGTTAAAGTATTTGGACAAGAAGTGGCTTATGTCAAC
TTTGACAAGACCATCATTGAAGAAGCCATACCGATGGTTA
CTGGACCCAAACCACGTGCACTGCTGAAGGAGGCTCTTAA
AGCTTTGCAGGAAGGAGTTGCCTTCCAGTATGCCAAACCT
TTGCTCGCAGCTGAAGTGCGTCGTATCTTGCCAACTGCAG
TTGGTGTGCCCATGGAGTTCAGTTGGTACACTGCTGCTGT
TGCTGCTGCATCTGTCAATGTTCAGGCCACCATTACACCT
GCTCTCCCTGAGAAATTGGAGTCCATGACTTATGAGCAAC
TTAAGAAGACTGATGTTCAGTTCCAAGCTGAAGCTAGACC
AAGTGTTGCTCTCCAGACATTTGCTGTGATGGGAGTTAAC
ACTGCCTTCATCCAAGCTGCTGTTATGGCGAGAGGAAAGA
TCCGTACAATTGCCCCTGGAAAAGTGGCAGCAAGAGCAGA
CATTCTCAAGGGCAACTACAAGGTGGAGGCTCTGCCTGTT
GATCTTCCTGAACACATTGCTTCTGCAAGCTTTGAGACAC
ACGCTGTGGTCAGAAATATTGAAGATCATAGTGCTGAAAG
GTCTGTTCCATTGGTACCTCAATTATCACTGCAAAACTCC
CAAACATCAAATGCTAATGATTGGTCCTCTGAGATGTCAC
CTGATGTTTCAGTGAAAGCTCCTGCTCCATTTGACAGGAC
CCTCTGTTATGCTGTCCCATACATTGAAATTAAGGGATGT
GTTGAGGTGCACTCTCACAATGCTGCTTTTATCAGAAATT
CTACGCTGTTCTACATAATTGGACAGCACTCAGCCCATGT
TGCAGTGGCAAGAGCTGAAGGTCCTGCAGTTGAAAGGCTG
GAGTTTGAAGTTCAAGTTGGTCCTAGAGCTGCTGAGAGGC
TTGTTAAACAAATCAACATCATTGATGACGATACTCCTGA
AGGACAGGCTTTCTTGTTGAAACTGAGGGAAATCCTGGAC
ACTGAAGCTAAAAATGCACCCGTCTCTTCTGAAAGCAGCA
GCAGTAGCCGCAACAGCCGCAGCATCAGCAGCTCAAGCTC
AAACTCAAATTCAAATTCAAGCTCAAGCTCAAGTTCAAGC
TCAAGTTCAAGTTCAAGCTCAAGCTCCTCCATGTCCAGCT
CTCGTATGTCTAAGACTGCCACCATCATGGAGCCTTTCAG
GAAATTTCACAAAGACCGGTACTTGGCAGCACATAGTGCC
ACAAAGGATACTAGCAGCGGAAGTGCTGCAGCTAGCTTTG
AACAAATGCAGAAAAAGAATAGATTCCTTGGAAATGATAT
TCCACCTGTTTTTGCTATCATCGCCCGTGCTGTTAGAGCT
GACCAGAAGCTTCTGGGCTACCAACTGGCTGCTTACTTTG
ACAAACCAACTGCAAGAGTGCAACTCATAGCTTCCTCCAT
TGCTGAAAATGACAACATGAAGATCTGTGCTGATGGTGCT
CTGCTGAGCAAGCACAAAGTCACTGCCAAGTTTTCTTGGG
GTGCGGAGTGCAAACAGTATGCAGTCTTTGCTAAAGCTGA
AGCTGGTGTCCTGGGTGAATACCCTGCTGCACGTCTAGAG
GTGGAATGGGAGAGACTGCCAAAAATTGTCACCACCTATG
CTAAAAAGCTTTCTAAATGCATACTTAATGCAGCTTATGA
CACAGGATTCAGGTTTGAAAAAGCAACAAACAGCGAGAAA
GAGATTGAACTGACTGCAGCCTTGCCATCTCAGAGGTCCT
TGAATGTCATTGCTAGGATTCCAGAGATCACAATGTCAAA
AAGGGATATTTACCTCCCCGTCACTGTTCCCATCAATCCA
GATGGAACTTTTTCCATTAATGAGGACTTTCTTTCCTGGA
TTCACAAGTATATTAAGGAGGATTGAGGAATGAATTGCAA
TCTCCATTTTCAAAAGAAAATAGGAGCTGTGTTAATGCAT
AACTGTCAGTTTAATCAATATTATTTTGTAATGTGATGCT
AATAAATACCCTGCAAGTGTAAGAA

OTTDART00000012279 (1) [ Show ] (double-click sequence to select) [Download]
>tpe|OTTDART00000012279|OTTDARG00000010637|ZDB-GENE-001201-5 vtg6|OTTDARP00000010565 RP71-23D18.1-001 LG_ BX539332.13 Danio rerio protein_coding NOVEL, 4225 bp
ACAAACCACCAGCAATGAGAGCTGTTGTGCTTGCCCTGAC
GGTAGCCCTTGTGGCGAGTCAACAGTTCAACCTTGTTCCC
GAGTTTGCCCATGATAAGACCTATGTGTACAAGTATGAGG
CTTTGCTCTTGGGTGGTCTTCCTCAAGAAGGTCTCGCCAG
AGCAGGTATCAAAGTCAGCAGCAAGGTTCGTCTGAGTGCC
ATGACAGAGAACACCTACCTGATGAAGCTTATGGATCCTC
TACTCTACGAGTATGCTGGCACTTGGCCCAAGGATTCATT
TGTTCCTGCCACTAAGCTCACCTCAGCACTGGCTGCTCAG
CTTCAGATTCCTATCAAGTTTGAGTATGCTAATGGTGTGG
TTGGCAAGGTTTTCGCCCCAGCAGGAGTCTCTCCTACTGT
CATGAACTTGCACAGAGGTATCCTCAACATCCTTCAGCTC
AACCTCAAGAAGACGCAGAACATCTACGAGCTGCAAGAGG
CTGGAGCTCAGGGAGTGTGCAGGACACACTATGTCATCAA
TGAAGATCCAAAAACCAACCACATTATTGTCACCAAGTCT
AAGGATCTGAGCCACTGCCAGGAGAGAATCATGAAAGATG
TTGGCTTGGCATACACTGAGAGGTGTGCTGAATGCACAAA
GAGGGTCAAGAGTCTGATTGAAACTGCAACTTATAACTAC
ATCATGAAACCAGCTGACAATGGTGCACTGATCGCTGAGG
CAACAGTTGAGGAAGTGTATCAGTTCTCACCCTTCAATGA
GATCCATGGTGCTGCAATGATGGAAGCAAAACAAACCTTG
GCTTTTGTGGAGATTGAGAAGACCCCTGTTGTTCCAATCA
AAGCTGATTACATGCCCCGTGGATCCCTGCAGTACGAGTT
TGCATCTGAGATTCTTCAGACCCCCATTCAACTCATGAAG
ATCAAAGATGCACCAGCCCAGATTGTCGAGGTCCTGAAGC
ACTTGGTAGAAAACAATAAAGACATGGTCCATGATGATGC
TCCATTCAAGTTTGTACAACTTGTTCAGCTCCTGCGTGTT
GTCACCTTGGACAAAATTGAGGCTATCTGGTCTCAGTTCA
AGGACAAACCAGTTTACAGGCGCTGGCTTCTGGATGCTCT
TCCTGCTGTTGGAACACCAGTCATTATAAAATTTATCAAG
GAGAAGTTCCTGGCTGGTGAATTTACAACTCCTGAGTTCA
TTCAGACTCTTGTGATTGCTCTGCAAATGGTCACTGCTGA
TCTTGAAACCATCCAAATGACAGCTAGTTTGGCTATGCAT
GAGAAATTTGTCTCAATCCCAGCTTTGCGTGAAGTTGTCA
TGCTTGGATATGGTTCCTTGATTGCCAAGCACTGTGTTGC
AGTTCCCACTTGCCCTGCTGAGCTCCTCAGGCCCATTCAT
GAGACTGCCACAGAGGCCATTTCTAAGAATGACATTCCTG
AAATCACTTTGGCTCTGAAAGTTATGGGCAATGCTGGTCA
CCCTTCAAGTCTTAAACCCATCATGAAGCTCCTACCTGGA
CTGAGAACTGCAGCTAATGCTCTGCCCGTTAGAGTCCAGG
TTGATGCCATCTTGGCCCTGAGGAACATTGCCAAGAAAGA
ACCCAAACTGGTTCAGCCTGTTGCCCTGCAGCTTGTTTTG
GACAGGGCTCTCCACCCAGAGGTGCGCATGGTTGCTTGTA
TTGTGCTGTTTGAGACTGAGCCTTCAGTGGCTCTCATCTC
CAGTCTTGCTGGAGCTTTGAGGACTGAGCCAAACATGCAT
GTTGCAAGCTTTGCCTATTCCCACATCAAGTCCTTGACCA
GAATCACTGCTCCTGATATGGCATATGTTGCTGGTGCAGC
TAATGTTGCCATCAAGCTTATGAACTGCAAGCTGGACAGA
CTTAACTACCGTTATAGCAGAGCTTTTCAGATGGACTATT
ATTATACTCCTCTTATGATTGGAGCTGCTGGTAGTGCCTA
TATGATCAATGATGCTGCCACCATCCTGCCCAGAGCTGTT
GTAGCTAAAGCACGTACTTACCTGGCTGGAGCCGCTGCTG
ATGTTGTTGAGTTTGGTGTGAGAACTGGAGGAATCAATGA
GGCTCTTCTAAAATCTCCTGCTGCAGATGAAAGTGTTGAC
CGTATCACAAAGATTAAGCGTACACTGAAAGCACTCACAA
ACTGGAAGGCTTTGCCAACTGATAAACCACTTGCTTCAGC
CTATGTTAAAGTATTTGGACAAGAAGTGGCTTATGTCAAC
TTTGACAAGACCATCATTGAAGAAGCCATACCGATGGTTA
CTGGACCCAAACCACGTGCACTGCTGAAGGAGGCTCTTAA
AGCTTTGCAGGAAGGAGTTGCCTTCCAGTATGCCAAACCT
TTGCTCGCAGCTGAAGTGCGTCGTATCTTGCCAACTGCAG
TTGGTGTGCCCATGGAGTTCAGTTGGTACACTGCTGCTGT
TGCTGCTGCATCTGTCAATGTTCAGGCCACCATTACACCT
GCTCTCCCTGAGAAATTGGAGTCCATGACTTATGAGCAAC
TTAAGAAGACTGATGTTCAGTTCCAAGCTGAAGCTAGACC
AAGTGTTGCTCTCCAGACATTTGCTGTGATGGGAGTTAAC
ACTGCCTTCATCCAAGCTGCTGTTATGGCGAGAGGAAAGA
TCCGTACAATTGCCCCTGGAAAAGTGGCAGCAAGAGCAGA
CATTCTCAAGGGCAACTACAAGGTGGAGGCTCTGCCTGTT
GATCTTCCTGAACACATTGCTTCTGCAAGCTTTGAGACAC
ACGCTGTGGTCAGAAATATTGAAGATCATAGTGCTGAAAG
GTCTGTTCCATTGGTACCTCAATTATCACTGCAAAACTCC
CAAACATCAAATGCTAATGATTGGTCCTCTGAGATGTCAC
CTGATGTTTCAGTGAAAGCTCCTGCTCCATTTGACAGGAC
CCTCTGTTATGCTGTCCCATACATTGAAATTAAGGGATGT
GTTGAGGTGCACTCTCACAATGCTGCTTTTATCAGAAATT
CTACGCTGTTCTACATAATTGGACAGCACTCAGCCCATGT
TGCAGTGGCAAGAGCTGAAGGTCCTGCAGTTGAAAGGCTG
GAGTTTGAAGTTCAAGTTGGTCCTAGAGCTGCTGAGAGGC
TTGTTAAACAAATCAACATCATTGATGACGATACTCCTGA
AGGACAGGCTTTCTTGTTGAAACTGAGGGAAATCCTGGAC
ACTGAAGCTAAAAATGCACCCGTCTCTTCTGAAAGCAGCA
GCAGTAGCCGCAACAGCCGCAGCATCAGCAGCTCAAGCTC
AAACTCAAATTCAAATTCAAGCTCAAGCTCAAGTTCAAGC
TCAAGTTCAAGTTCAAGCTCAAGCTCCTCCATGTCCAGCT
CTCGTATGTCTAAGACTGCCACCATCATGGAGCCTTTCAG
GAAATTTCACAAAGACCGGTACTTGGCAGCACATAGTGCC
ACAAAGGATACTAGCAGCGGAAGTGCTGCAGCTAGCTTTG
AACAAATGCAGAAAAAGAATAGATTCCTTGGAAATGATAT
TCCACCTGTTTTTGCTATCATCGCCCGTGCTGTTAGAGCT
GACCAGAAGCTTCTGGGCTACCAACTGGCTGCTTACTTTG
ACAAACCAACTGCAAGAGTGCAACTCATAGCTTCCTCCAT
TGCTGAAAATGACAACATGAAGATCTGTGCTGATGGTGCT
CTGCTGAGCAAGCACAAAGTCACTGCCAAGTTTTCTTGGG
GTGCGGAGTGCAAACAGTATGCAGTCTTTGCTAAAGCTGA
AGCTGGTGTCCTGGGTGAATACCCTGCTGCACGTCTAGAG
GTGGAATGGGAGAGACTGCCAAAAATTGTCACCACCTATG
CTAAAAAGCTTTCTAAATGCATACTTAATGCAGCTTATGA
CACAGGATTCAGGTTTGAAAAAGCAACAAACAGCGAGAAA
GAGATTGAACTGACTGCAGCCTTGCCATCTCAGAGGTCCT
TGAATGTCATTGCTAGGATTCCAGAGATCACAATGTCAAA
AAGGGATATTTACCTCCCCGTCACTGTTCCCATCAATCCA
GATGGAACTTTTTCCATTAATGAGGACTTTCTTTCCTGGA
TTCACAAGTATATTAAGGAGGATTGAGGAATGAATTGCAA
TCTCCATTTTCAAAAGAAAATAGGAGCTGTGTTAATGCAT
AACTGTCAGTTTAATCAATATTATTTTGTAATGTGATGCT
AATAAATACCCTGCAAGTGTAAGAA

Segment Relationships
Protein Products
No data available
Supporting Sequences
Citations